O melhor lugar para ficar em Makatea é geralmente nas aldeias principais de Mou'a, Temao e Vaitepaua, pois estes são os principais centros de atividade e acomodação na ilha.
Mou'a, localizada no planalto, é uma das maiores aldeias e oferece uma sensação da vida cotidiana da ilha. Está perto do centro administrativo da ilha e oferece uma boa base para explorar as características geológicas únicas de Makatea, como seus penhascos e grutas de coral elevados. Esta área é adequada para viajantes que apreciam uma experiência mais autêntica e querem entender a história e a comunidade da ilha.
Temao e Vaitepaua, situadas mais perto da costa, oferecem acesso mais fácil ao oceano. Nestas aldeias, você geralmente encontrará pensões que proporcionam uma conexão mais direta com a pesca, o snorkeling e a apreciação da costa natural da ilha.