A melhor época para visitar a Ilha Rubondo é durante as estações secas, que vão de junho a agosto e depois novamente de dezembro a fevereiro.
Esses períodos oferecem o clima mais agradável para explorar a ilha. Você encontrará menos chuva, menor umidade e geralmente céus mais claros, tornando-o ideal para observação da vida selvagem e atividades ao ar livre, como caminhadas na floresta ou pescarias no Lago Vitória. Os animais também são mais fáceis de serem avistados, pois se congregam em torno das fontes de água.
Para aqueles interessados em observação de aves, a estação das aves migratórias de dezembro a fevereiro é particularmente gratificante. Durante este período, a ilha recebe um influxo de várias espécies de aves, adicionando à já rica avifauna local.